Você pode forçar o iTunes a criptografar todos os seus backups com facilidade, mas você também precisará excluir os backups antigos que não estão criptografados. Continue lendo para saber como fazer as duas coisas.
Criptografando Backups Futuros
Dê uma senha segura, mas também aquele que você pode lembrar, já que esquecer isso fará com que seus backups sejam inúteis, já que você não poderá restaurar nenhum deles sem ele. Depois de escolher uma senha, o iTunes começará a fazer um backup criptografado do seu dispositivo. Quando isso for feito, você deve excluir seus backups antigos e não criptografados.
Excluindo backups antigos
Para excluir backups no iTunes, abra suas preferências (iTunes -> Preferências no OS X ou Editar -> Preferências no Windows) e, em seguida, vá para a guia "Dispositivos". Você deve ver uma lista de todos os seus backups, juntamente com um prático botão "Excluir backup". Basta selecionar o backup que você deseja excluir e, em seguida, pressionar o botão. Faça isso para todos os seus backups não criptografados e ninguém deve ser capaz de rastrear sua localização no seu computador sem fazer um esforço sério para isso.